根據“讀賣新聞”的統計，廢除國家核電設施的總成本 - 不包括福島第一核電站和其他在建設施 - 估計約為6.72萬億日元。評估僅包括拆除目前可以估算費用的核電設施。
在這些估算中，日本核燃料有限公司(JNFL)在青森縣六所市建造的廢核燃料后處理廠的關閉成本最高，為1.6萬億日元。
估計53個商業核反應堆退役的費用總計約為3.58萬億日元，平均每個反應堆的費用為577億日元。在53個反應堆中，有19個反應堆被安排或可能被廢棄。
在53個反應堆退役過程中產生的低放射性廢物(不包括乏核燃料)預計總量為487,140噸，平均每個反應堆9,191噸。
該計數不包括對正在建設中的核電廠進行評估的評估以及東京電力公司控股公司的福島第一核電站被大東方摧毀的第1,2,3和4號反應堆的評估2011年的日本地震 - 目前難以估計數字。
關閉非商業用途核電設施的費用總計約為3.66萬億日元。其中，日本原子能機構擁有的79座核設施退役的費用估計總計約為1.9萬億日元，其中包括用于關閉茨城縣東海村核燃料后處理廠的7,700億日元。
JNFL表示，包括六所村核燃料后處理廠在內的五個設施的退役成本估計為1.73萬億日元。
后處理廠的規模如此之大，以至于潛在的放射性廢物的數量可能會增加，因此使這種設施退役的成本變得巨大。
在2017年修訂的核反應堆和其他核反應堆法律中，核電廠運營商有義務在2018年底之前發布廢棄核電設施的執法政策 - 例如退役設施的估計費用和放射性數量拆除后會產生的廢物。
國際原子能機構于2016年向日本政府提交了一份報告，其中要求釋放退役核設施的政策。
